面對4000多種單基因遺傳病,產(chǎn)前基因篩查能否把好關(guān)?
21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報道記者 朱萍 實習(xí)生 王馨漪 成都報道 “目前從基因上面大概有4000-5000多種是明確定義的單基因遺傳病。學(xué)術(shù)界一致認(rèn)可的是,包括各種隱性的、顯性的單基因遺傳病,發(fā)病率總額5%以下?!苯眨袊t(yī)學(xué)科學(xué)院成都協(xié)和醫(yī)院婦產(chǎn)科副主任醫(yī)師蔣宇林在接受21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報道記者采訪時指出,單基因遺傳病是由單個基因來控制是否發(fā)病的遺傳病,分為顯性、隱性以及連鎖遺傳等類型,包括軟骨發(fā)育不全、地中海貧血、脊髓性肌萎縮癥(SMA)白化病等。
若出生后進(jìn)行診療,大多癥狀嚴(yán)重且診治困難;若進(jìn)行產(chǎn)前檢查,單基因遺傳病大多無法通過超聲、無創(chuàng)等常規(guī)產(chǎn)檢檢出,所以攜帶者篩查的重要性就凸顯出來,從檢測胎兒自身癥狀轉(zhuǎn)為篩查父母基因,從而評估胎兒患病風(fēng)險,將預(yù)防窗口前移。
蔣宇林指出,對攜帶者進(jìn)行篩查是去識別高危因素的一個重點方面?!叭缤ㄟ^對孕前夫妻的遺傳學(xué)診斷,發(fā)現(xiàn)在某個基因上是碰對的,在孕期就可以去針對性去查,看是否遺傳了他們各自帶有的遺傳突變位點,若兩邊都遺傳,孩子很可能就是一個患者,這樣的方式,也是我們在孕期去針對宮內(nèi)去做排查的比較有利的手段,但只能是針對一些常見的單基因隱性遺傳病,至于顯性病這些是沒有辦法去做預(yù)測的,因為遺傳診斷是比較復(fù)雜的?!?/p>
據(jù)了解,目前攜帶者基因篩查技術(shù)已經(jīng)較為成熟,就在不久前,貝瑞基因基于ACMG(美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)與基因組學(xué)學(xué)會)最新《指南》,并結(jié)合中國臨床需求,發(fā)布了可以篩查129個基因153種遺傳病的攜心安?擴(kuò)展性攜帶者篩查(標(biāo)準(zhǔn)版),樣本檢測周期一般為實驗室收樣后15個工作日。
什么是單基因遺傳病?
單基因遺傳病是由單個基因來控制是否發(fā)病的遺傳病,分為顯性、隱性和性連鎖遺傳幾種類型。其特征是一個基因出現(xiàn)了問題或者異常而導(dǎo)致了相應(yīng)的疾病。與之對應(yīng)的還有多基因病,指病因無法歸結(jié)到某一個具體的基因的問題,可能是環(huán)境因素引起發(fā)病。比如高血壓、糖尿病,可能是與患者運動、飲食等生活習(xí)慣有關(guān)。
單基因病的病因主要是基因變異,包括遺傳和新發(fā)突變兩種類型。蔣宇林向21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報道記者指出,總體來看,新發(fā)突變即變異的數(shù)量更多,但變異絕不是一個罕見的現(xiàn)象。在人類發(fā)展進(jìn)化的過程中,變異時常發(fā)生,如人類變得更強(qiáng)壯、更聰明、對疾病的抵抗更強(qiáng)或者繁殖能力更好,這些都是正向的變異;同時,人類也會發(fā)生很多負(fù)向的變異,如父母在這個疾病上均沒有突變的位點,但孩子在受精卵的形成過程中出現(xiàn)突變。甚至,如果這種變異造成的疾病不致死、仍保留生殖能力,這種變異還將遺傳給下一代。
其中,針對隱性遺傳造成的基因疾病值得關(guān)注。如果父母中只存在一個隱性基因的攜帶者,后代并不會發(fā)病,只有父母均攜帶該隱性基因時,后代才會發(fā)病。因此,隱性遺傳更加隱蔽。此外,隱性遺傳是存在預(yù)防和改善辦法的。蔣宇林指出,正是由于可以確認(rèn)夫婦是否攜帶隱性基因,醫(yī)生才可以預(yù)期發(fā)病幾率,進(jìn)行疾病干預(yù)。
蔣宇林表示,很多單基因遺傳病都是罕見病,目前有大概4000種以上明確定義的單基因遺傳病。從新生兒角度來看,比較常見的單基因病有遺傳性耳聾,還有一些代謝性疾病比如甲基丙二酸血癥、苯丙酮尿癥,神經(jīng)肌肉病比如脊髓肌萎縮癥、DMD(杜氏肌營養(yǎng)不良);在產(chǎn)前階段,醫(yī)生還會看到更多骨骼、腎臟和泌尿系統(tǒng)、心臟和顱內(nèi)心結(jié)構(gòu)發(fā)育相關(guān)的單基因病。
哪些單基因遺傳病比較嚴(yán)重?蔣宇林指出,由于缺乏界定“嚴(yán)重”的統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn),沒有辦法判定哪種類型的遺傳病“更嚴(yán)重”,學(xué)術(shù)界一直存在很大爭議。而從非學(xué)術(shù)的角度來看,一般認(rèn)為早期致死的遺傳病,或者必須進(jìn)行復(fù)雜外科手術(shù)干預(yù)的遺傳病更加嚴(yán)重。同時,在遺傳病診斷領(lǐng)域,也普遍認(rèn)為神經(jīng)認(rèn)知方面的疾病比較嚴(yán)重。
單基因遺傳病能否避免?
蔣宇林向21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報道記者指出,在胎兒期,最大的困難是如何發(fā)現(xiàn)單基因遺傳病。由于單基因無法用肉眼看見,醫(yī)生只能依靠影像學(xué)評估,關(guān)注在產(chǎn)前檢查過程中是否發(fā)現(xiàn)胎兒的結(jié)構(gòu)問題或者發(fā)育異常,比如羊水特別多、胎兒偏小等。但通過蛛絲馬跡來判斷胎兒是否存在問題,是非常困難的,對影像學(xué)醫(yī)生的能力有很高要求。因為很多遺傳病在宮內(nèi)結(jié)構(gòu)上沒有任何表現(xiàn),醫(yī)生無法在胎兒外觀正常的情況下去關(guān)注胎兒是否出現(xiàn)問題,比如智力、語言等功能性發(fā)育是否正常。
而對于已經(jīng)生下來的孩子,遺傳病診斷遇到的最大問題是兒科醫(yī)生遺傳診斷能力的差異?!拔覀円娏撕芏嗟暮⒆?、家庭,都是經(jīng)過了很多波折,看了很多醫(yī)生。不同的醫(yī)院給出各種各樣的說法,最后終于遇到某個大夫、做了某個檢測,才診斷出是單基因遺傳病,再轉(zhuǎn)診到對口的機(jī)構(gòu)就診?!笔Y宇林表示,許多兒科醫(yī)生對遺傳病的診斷能力較弱,無法在患者第一次就診時就指出病因。
正因為遺傳病診斷的困難性和必要性,攜帶者篩查的出現(xiàn)能夠更好地預(yù)防單基因隱性遺傳病。據(jù)21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報道記者了解,不久前,貝瑞基因發(fā)布了攜心安?擴(kuò)展性攜帶者篩查(標(biāo)準(zhǔn)版),針對致病基因攜帶率高的153種單基因隱性遺傳病進(jìn)行篩查,包括常染色體隱性遺傳病及X連鎖隱性遺傳病。
上述產(chǎn)品的市場容量十分巨大。具體而言,適用群體包括無表型、不良孕產(chǎn)史或遺傳病家族史的備孕期或孕早期夫婦、輔助生殖人群。而慎用的人群是高風(fēng)險人群,即建議做遺傳病診斷而非篩查的人群,比如有表型、不良孕產(chǎn)史或家族遺傳史的夫婦、妊娠發(fā)現(xiàn)胎兒B超結(jié)構(gòu)畸形等異常的夫婦。
對于產(chǎn)品是否應(yīng)該涵蓋所有涉及的單基因隱性遺傳病,貝瑞基因董事長、總經(jīng)理高揚向21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報道記者指出,這是一個需要從實際出發(fā)逐步實現(xiàn)的問題。根據(jù)美國的ACMG《指南》,單基因隱性遺傳病基于攜帶頻率分為四個層級。第一階梯(Tier1)的疾病是中國人群里最常見、危害最大的這幾種病,最應(yīng)該防治;第二階梯(Tier2)和第三階梯(Tier3)是在指定人群里攜帶率大于1/100的和1/200的,應(yīng)該納入普通人群的攜帶列表。因此,貝瑞基因的產(chǎn)品按照《指南》要求,覆蓋了前三個層級。
ACMG指南對單基因隱性遺傳病篩查四個層級的劃分
“也有些專家認(rèn)為沒有必要篩查這么多種疾病,這種觀點是從常見疾病綜合防治的角度來建議的,希望能夠在中國人群內(nèi)普及、實現(xiàn)核心Tier1級的攜帶者篩查。但我們根據(jù)指南要求做到Tier3級,是因為攜帶率1/200已經(jīng)是較高的數(shù)值,從個體家庭角度看是比較重要的?!备邠P告訴21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報道記者。另外,還有一些專家認(rèn)為,如果有能力,篩查應(yīng)該涵蓋所有單基因隱性遺傳病。高揚解釋,一方面,從純粹技術(shù)而言可以實現(xiàn)所有的篩查,但是從實際的臨床應(yīng)用方面可能會導(dǎo)致太多的陽性結(jié)果。另一方面,這種篩查的性價比并不高。不過在未來,相信攜帶者篩查品種會伴隨著臨床診斷的實際情況納入更多的疾病。
單基因遺傳病篩查市場有多大?有專家表示,目前沒有具體統(tǒng)計數(shù)據(jù),在美國該技術(shù)應(yīng)用較為成熟與廣泛,根據(jù)覆蓋病種不同,定價在200至1000美元左右,含在孕產(chǎn)險中,由商業(yè)保險支付。“有市場預(yù)估,英國、美國每年包含單基因遺傳病篩查、新生兒篩查等檢測項目在百萬人份級別的檢測量。”
其中單基因遺傳病篩查的對象包括所有有生育需求及懷孕中的人群。高揚也進(jìn)一步向21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報道記者指出,所有想要寶寶的人群都是它所針對的市場,它跟基因病診斷不一樣,基因病診斷針對的市場是已經(jīng)有基因病表現(xiàn)的患者;攜帶者篩查針對的是普通的、有生育需求的人的市場,無論是自然懷孕還是通過輔助生殖的手段。
基因報告解讀仍有提升空間
基因檢測、基因解讀、基因編輯和基因治療等技術(shù)正快速發(fā)展,但蔣宇林指出,目前基因治療有針對已出生的孩子進(jìn)行開展,還沒有在宮內(nèi)進(jìn)行。雖然基因編輯技術(shù)的熱度很高,技術(shù)也在不斷發(fā)展完善,但還沒有進(jìn)入臨床階段。
“基因編輯能否逆轉(zhuǎn)基因突變是沒有定性的,還有可能引起其他基因的問題,如果貿(mào)然在胎兒身上進(jìn)行,就突破了倫理的底線?!笔Y宇林向21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報道記者表示。
與此同時,我國基因檢測的解讀也有提升空間,可以借鑒國外好的經(jīng)驗,制定嚴(yán)格的解讀標(biāo)準(zhǔn),規(guī)范數(shù)據(jù)的生產(chǎn)過程,或者引入第三方幫助對報告進(jìn)行認(rèn)證,把控質(zhì)量,從而進(jìn)一步提升解讀的準(zhǔn)確性。
另據(jù)業(yè)內(nèi)人士表示,在我國,醫(yī)療行為的執(zhí)行主體必須是醫(yī)院而不能是第三方機(jī)構(gòu),也亟需加強(qiáng)醫(yī)學(xué)遺傳科的建設(shè),尤其是提升核心公立醫(yī)院的能力,從而廣泛影響到整個醫(yī)療系統(tǒng),實現(xiàn)“基層醫(yī)院可識別,上級醫(yī)院可篩查,核心醫(yī)院可診斷”的網(wǎng)絡(luò)化目標(biāo)。
除此之外,基因解讀本身的難度也較大,對分析人員的能力要求極高。如果一個分析人員有豐富的分析經(jīng)驗,對臨床疾病和數(shù)據(jù)庫的使用很熟悉,那么其解讀會更全面準(zhǔn)確。蔣宇林指出:“基因解讀依賴于分析人員投入的時間和精力,閱讀1篇、100篇和1000篇文獻(xiàn)的效果是不同的,影響到分析人員搜集到信息的廣度,進(jìn)而影響到解讀的質(zhì)量?!?/p>
為了節(jié)約成本和時間,很多實驗室會選擇借助AI技術(shù)初篩,提高效率。但是,自動化初篩也會存在一些問題,比如遺漏一些遺傳病的可能性,比對分析做得不夠充分等。因此,蔣宇林表示,在基因解讀上,需要合理運用人類的專業(yè)經(jīng)驗和AI技術(shù),才能進(jìn)一步提高基因解讀的準(zhǔn)確性。